از جمله مهمترین چالشهای دوره ۱۴ ساله صدر اعظمی مرکل، موضوع توافق هستهای است که با خروج آمریکا اعتبار کشور او را به عنوان یکی از طرفهای اروپایی برجام خدشه دار کرده است.