رئیسجمهور پس از رأی اعتماد سی خرداد مجلس شورای اسلامی به محمد علی نیکبخت، ۱۳ مأموریت مهم را به وزیر جهاد کشاورزی ابلاغ کرد.
۱. برنامه ریزی و اجرای سیاست های کلی و اسناد بالادستی در حوزه کشاورزی
۲. اهتمام ویژه جهت رسیدن به امنیت غذایی با رویکرد تنوع بخشی
۳. تأمین داخلی نهاده ها و خود کفایی در کالاهای اساسی
۴. توسعه زنجیره ارزش محصولات کشاورزی
۵. هوشمند_سازی فرایند مزرعه تا بازار
۶. بهره مندی حداکثری از علم و فناوری با هدف افزایش بهره وری و مصرف بهینه آب
۷. حفظ و احیای پایدار منابع طبیعی و اراضی کشاورزی
۸. برخورد قاطع با تغییر کاربری های غیرمجاز
۹. ایجاد الگوهای نوین پایدار و اقتصادی کشور
۱۰. ایجاد و راه اندازی الگوی نوین حکمرانی کشاورزی بر پایه احصاء داده های کشاورزی به صورت برخط و مکان محور
۱۱. تحول معنادار در مولدسازی ظرفیت های تولیدی کشاورزی
۱۲. اتخاذ رویکرد مردمی سازی حداکثری
۱۳. شناسایی و استفاده از مدیران جوان انقلابی، متخصص و تحول گرا